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QuantSeq 3'mRNA-Seq文庫制備試劑盒,用于Illumina
在QuantSeq文庫制備過程中節(jié)省成本并簡化了球蛋白mRNA的消耗
全基因組基因表達(dá)分析
具有成本效益的微陣列和標(biāo)準(zhǔn)RNA-Seq替代品
總RNA輸入低100 pg
適用于低質(zhì)量和FFPE樣品
在Bluebee的免費(fèi)數(shù)據(jù)分析管道®基因組學(xué)分析平臺
單讀數(shù)測序,多達(dá)9,216個樣品/泳道
提供雙重索引和唯yi分子標(biāo)識符(UMI)
QuantSeq 3'mRNA-Seq文庫制備試劑盒,用于Illumina
QuantSeq FWD試劑盒是一種文庫制備方案,旨在生成與聚腺苷酸化RNA的3'末端接近的Illumina兼容文庫。
QuantSeq FWD在第二條鏈合成引物中包含Illumina Read 1接頭序列,因此朝poly(A)尾部生成NGS讀數(shù),直接反映了mRNA序列(請參見工作流程)。此版本是基因表達(dá)分析的推薦標(biāo)準(zhǔn)。Lexogen進(jìn)一步提供了具有可選雙索引(i5和i7索引)的高通量版本,允許在一個通道中多路復(fù)用多達(dá)9,216個樣本。
低投入低質(zhì)量樣品分析
總RNA的所需輸入量低100pg。QuantSeq適合從低質(zhì)量的RNA(包括FFPE樣品)可重復(fù)生成文庫。相同樣品的兩種不同RNA品質(zhì)(FFPE和新鮮冷凍冷凍塊)的比較
QuantSeq文庫制備過程中耗盡球蛋白mRNA
新! 用于QuantSeq的Globin塊模塊可從全血中僅50 ng的總RNA中生成缺失珠蛋白的,易于測序的3'mRNA-Seq文庫。無需其他協(xié)議步驟。該模塊中的RS-Globin Block解決方案僅取代了QuantSeq試劑盒中的標(biāo)準(zhǔn)RNA去除解決方案。使用Globin Block進(jìn)行QuantSeq,可將映射到球蛋白mRNA的讀圖從50%到80%降低到5%(圖4),并且基因檢測顯著增加(圖5)。
*對于附圖:輸入RNA(50 ng或250 ng)的提取方法如下:1個 SPLIT RNA提取試劑盒,2個其他試劑盒(包括紅細(xì)胞裂解液)或3個其他試劑盒沒有紅細(xì)胞裂解液
快速周轉(zhuǎn)
QuantSeq的簡單工作流程允許僅在4.5小時內(nèi)(包括不到2小時的動手時間)生成即可測序的NGS庫。
基因表達(dá)定量的直接計(jì)數(shù)
每個轉(zhuǎn)錄本僅產(chǎn)生一個片段;因此,不需要長度標(biāo)準(zhǔn)化。這樣可以更準(zhǔn)確地確定基因表達(dá)值,并使QuantSeq成為基因表達(dá)研究中微陣列和常規(guī)RNA-Seq的佳替代品。
簡單的生物信息學(xué)分析
通過跳過結(jié)檢測,可以簡化讀取映射。在轉(zhuǎn)錄物的3'末端幾乎沒有連接處產(chǎn)生讀數(shù)。因此可以加速數(shù)據(jù)處理。
QuantSeq數(shù)據(jù)分析管道還集成在Bluebee基因組學(xué)分析平臺上,即使沒有生物信息學(xué)背景,任何用戶也可以使用。訪問代碼包含在QuantSeq套件中。可以在網(wǎng)上商店購買其他代碼。*:直到2019年12月31日,免費(fèi)提供高達(dá)1.5 GB輸入的附加代碼。
高鏈特異性
QuantSeq保持> 99.9%的異常鏈特異性,并允許將讀數(shù)映射到基因組上的相應(yīng)鏈,從而能夠發(fā)現(xiàn)和定量反義轉(zhuǎn)錄本和重疊基因。
節(jié)省成本的復(fù)用
QuantSeq庫旨在用于高度復(fù)用。單個索引套件(目錄號015)中多包括96個i7索引。還可以使用Lexogen i5 6 nt雙索引附加組件(目錄號047或015.384)引入其他i5索引。一起使用,Lexogen的96 i7和96 i5 6 nt索引可為測序提供多達(dá)9,216種不同的索引組合。
新!QuantSeq 3'mRNA-Seq文庫制備物現(xiàn)在也可提供多達(dá)384種預(yù)混合的*雙索引(目錄號113、114、115)。Lexogen的新型12 nt UDI具有出色的糾錯功能,可大程度地輸出測序數(shù)據(jù),也可作為獨(dú)立的附加套件(目錄號107 – 111)與其他文庫制備工具一起使用。
這種高水平的多路復(fù)用可以節(jié)省成本,因?yàn)镼uantSeq中的長度限制可以節(jié)省測序空間。QuantSeq還設(shè)計(jì)用于產(chǎn)生短測序讀段(SR50,SR100)的插入片段大小。
北京華新康信生物科技有限公司專注于生命科學(xué)領(lǐng)域,由豐富從業(yè)經(jīng)驗(yàn)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)和管理團(tuán)隊(duì)組建而成,主營生物化學(xué)試劑,儀器,實(shí)驗(yàn)耗材等。
1廣泛的產(chǎn)品輻射領(lǐng)域,試劑,耗材,儀器等。
2產(chǎn)品種類齊全,北京華新康信與國外諸多生命科學(xué)領(lǐng)域*合作眾多,代理品牌Glycan Therapeutics,Intact Genomics,Integral Molecular,Medkoo,Niomech,Terragene,Anshlabs wako,EZbioscience,CMCTAG,Anatrance ,F(xiàn)avorage ,Affinity,Advanced biomatrix,bioplastics,天地人和,TRC,凱杰,義翹,sciencell;價格優(yōu)勢品牌:seracare,Streck,Toxin,Zeptometrix,sigma,F(xiàn)orteBio,CanSyn,polyplus,santa,chormsystems,bethyl ,moltox, permagenlabware ,bioflux,Bio-Rad, coriell, listlabs, ZYMO , ABclonal , EY laboratories ,greatcellsolar , agdia , beckman , Bioxcell,,biomax ,usascientific , TRC ,nist ,americanelements,cayman , Fisher ,thermofisher , nanopore, 日立, 三菱株式會社 ,RD, takara等,緊跟生命科學(xué)的發(fā)展,不斷滿足客戶的需求,為各位的科研之路上添磚加瓦!
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